Aangeboren afwijkingen, ook wel congenitale afwijkingen genoemd, zijn afwijkingen die bij de geboorte aanwezig zijn. Ze betreffen dus zowel de erfelijke afwijkingen als de afwijkingen die tijdens de zwangerschap en de geboorte ontstaan.
Als in een familie van een of beide kanten een aangeboren aandoening voorkomt, bijvoorbeeld de taaislijmziekte of een andere aandoening, is het verstandig al vroeg contact met de arts op te nemen, zo mogelijk al bij het voornemen voor een zwangerschap. Houd er rekening mee dat de kans op een aangeboren afwijking ook toeneemt als de vrouw zwanger wordt na haar 36e jaar.